Dada la gran variabilidad del fenotipo clínico en individuos con Ataxia Espinocerebelosa tipo 2 (SCA2), se realizó un estudio transversal con el objetivo de caracterizar la relación existente entre factores genéticos y fisiológicos, y el fenotipo clínico en familias cubanas con esta enfermedad. Se partió de una muestra integrada por 1745 enfermos o con elevado riesgo. Los estudios moleculares se realizaron por PCR, RFLP y electroforesis en geles de agarosa y poliacrilamida. Se confirmó que el umbral patológico para el gen sca2 en la población cubana afectada por la enfermedad es de 32 repeticiones de CAG. Se definieron por primera vez rangos de alelos intermedios (25-31 CAGs), y de penetrancia incompleta (32-36 CAGs), y completa (≥37 CAGs) para los alelos sca2. Se evidenció que el sexo y la edad conceptiva del progenitor transmisor de la mutación influyen sobre la inestabilidad intergeneracional de alelos sca2 expandidos. Se demostró que el número de repeticiones de CAG en los alelos sca2 expandidos es el principal determinante del fenotipo clínico en la SCA2 y que los alelos sca2, sca3 y drpla normales, y el polimorfismo mitocóndrico 10398G, así como el sexo y el tiempo de evolución de la nfermedad, modifican la expresividad variable del fenotipo clínico.