Se presenta el papel del Laboratorio Nacional de Referencia (LNR) en la vigilancia clínico epidemiológica de los virus del sarampión, rubeola y parotiditis (PRS) durante los años 1988 al 2007. Se muestra el desarrollo de algoritmos de trabajo a medida que se introdujeron técnicas y diversos tipos de muestras en el diagnóstico y se observa la disminución de los casos positivos a sarampión desde un 16% en 1988 a un 0,3% en 1993, cuando se confirmaron los dos últimos casos de esta enfermedad en el país. Se demuestra la presencia de resultados falsos positivos en el ELISA (Ensayo inmunoenzimático sobre fase sólida, siglas del inglés, Enzime Linked Immnossorbent Assay) para la detección de anticuerpos de tipo IgM al virus del sarampión, siendo necesario tomar una segunda muestra para la confirmación de los casos por Inhibición de la Hemaglutinación (IH). La detección de la avidez de los anticuerpos de tipo IgG al virus de la rubeola, en las muestras de suero de los trabajadores cubanos involucrados en el brote del 2004, muestra un 88,2% de infección primaria al virus. Se confirman diferentes brotes de parotiditis a partir de 2004 en adolescentes y adultos jóvenes, encontrándose un 12,3%, 22,5% y 23% de positividad en los años 2005, 2006 y 2007 respectivamente. Al ser analizada la encuesta seroepidemiológica realizada en 1999, se halló una disminución en el nivel de los anticuerpos a sarampión y rubeola en la población de 6 a 10 años de edad. Los resultados de este trabajo, apoyaron la decisión de las autoridades de salud de incorporar al programa de inmunizaciones, la reactivación de la triple viral a los 6 años de edad y realizar una campaña de vacunación a la población entre 12 a 24 años, con esta misma vacuna.