En el trabajo se desarrolla el proceso de purificación del ADN plasmídico pIDKE2, componente principal del candidato vacunal CIGB 230.Por primera vez se describe el uso de la filtración tangencial en combinación con las cromatografías de fase reversa y exclusión molecular para la obtención de un plásmido con rendimiento de 0,76mg por gramo de biomasa húmeda, con una pureza del 94 ±2% y un recobrado total del 14%. Se realizó la modelación del proceso de purificación del plásmido pIDKE2, y se verificó la factibilidad económica del proyecto. Además se estableció una metodología a partir del uso de herramientas como el diseño experimental y la modelación para identificar los factores que tienen mayor influencia sobre el costo de producción y la cantidad de plásmido anual. Se demostró que el proceso de purificación del plásmido pIDKE2, puede ser escalado y cumple con las regulaciones vigentes. Los reactivos utilizados no representan reglamentaciones especial es, ya que no son tóxicos, mutagénicos ni inflamables. Por vez primera la autoridad regulatoria nacional autorizó el inicio de un estudio clínico en humanos de una formulación líquida que contiene un plásmido.