La cirugía refractiva corneal se encarga del tratamiento de ametropías, posibilita mejorar la agudeza visual sin corrección y genera un número creciente de procedimientos cada año. Se realizó un estudio descriptivo, prospectivo y longitudinal en 134 pacientes operados de ametropías con Láser Excímer, con los objetivos de determinar los cambios morfométricos corneales posteriores a este tratamiento a través de microscopía confocal de la córnea; la correlación entre estos cambios y la magnitud de la ametropía tratada, así como desarrollar modelos predictivos de variables morfométricas. Se utilizaron métodos de estadística descriptiva e inferencial, el análisis de varianza de medidas repetidas con corrección de Bonferroni, correlación de Pearson, Spearman y regresión lineal múltiple con validación cruzada. Se obtuvo una disminución de la paquimetría y densidad de queratocitos, aumento del grosor epitelial y modificaciones de las características del plexo nervioso subbasal, así como la correlación inversa significativa entre la magnitud de la ametropía tratada y la paquimetría, lecho estromal residual y densidad de queratocitos a ambos lados del corte lamelar en el LASIK y estroma anterior en el LASEK. Se obtienen modelos predictivos de morfometría corneal. Los datos obtenidos constituyen referentes para pacientes operados en Cuba con la novedosa tecnología Láser Excímer.